2025-06-07 19:44来源:本站
我们每个细胞内的基因组都是通过张力和扭转来模拟的——部分原因是蛋白质的活动,这些蛋白质使dna紧密、绕圈、包裹和解开——但科学家们对这些力量是如何影响基因转录的知之甚少。
小韦纳德·l·米勒博士(Dr. Waenard L. Miller, Jr.)的劳拉·芬齐(Laura Finzi)说,“有很多机械力一直在起作用,我们从未考虑过,我们对此知之甚少,教科书中也没有提到。”1969年,希拉·m·米勒在克莱姆森大学担任医学生物物理学教授。
转录是细胞将DNA片段复制成RNA的过程。一种被称为信使RNA (mRNA)的RNA对信息进行编码,以制造细胞或组织的结构和功能所需的蛋白质。
RNA聚合酶(RNAP)是一种产生mRNA的蛋白质。它沿着双螺旋DNA进行跟踪,将其解开以读取其中一条链的碱基对序列,并合成匹配的mRNA。当RNAP与“启动子”DNA序列结合时,基因的这种“转录”开始,并在mRNA拷贝被释放的“终止子”序列结束。规范的终止观点认为,在释放mRNA后,RNAP与DNA分离。
由Finzi领导的一个研究小组,包括克莱姆森物理与天文学系的研究教授David Dunlap,首次证明了力是如何在规范终止的另一种选择中发挥作用的。他们的研究发表在《自然通讯》杂志上。
使用磁性镊子沿着DNA模板拉RNAP聚合酶,研究人员能够证明,在到达终止子时,细菌RNA聚合酶可能留在DNA模板上,并被拉着向后滑动到相同的或向前滑动到相邻的启动子,开始随后的转录周期。因此,力的方向决定了DNA片段是可以多次转录还是只转录一次。Finzi和Dunlap报告说,这种力导向的循环机制可以改变邻近基因的相对丰度。
此外,他们发现滑动RNAP的能力需要α亚基的c端结构域识别与滑动方向相反的启动子。这些亚基“允许它保持在轨道上,翻转并抓住DNA双螺旋的另一条链,那里可能有另一个启动子,”她说。事实上,随着α亚基的删除,反向启动子的翻转不会发生。
对调控基因组转录活性的分子机制的透彻理解可能会确定RNAP可能被修饰以抑制某些蛋白质和预防疾病的治疗方案。
芬齐说,基因组中可能有一些地方的循环比其他地方更频繁,但这仍然是未知的。
“我的希望是,有一天我们将有一个作用于基因组的力的时空图,在我们生物体中各种类型的细胞的生命周期的不同时间。芬齐说:“我们的研究强调了力对重复转录概率的影响,这可能有助于以热图的方式预测和绘制不同基因的不同转录水平。”